Complete Genome Sequence of Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus R1-1 Using PacBio Single-Molecule Real-Time Technology

نویسندگان

  • You Lu
  • Deborah A. Samac
  • Jane Glazebrook
  • Carol A. Ishimaru
چکیده

We report here the complete genome sequence of Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus R1-1, isolated in Minnesota, USA. The R1-1 genome, generated by a de novo assembly of PacBio sequencing data, is the first complete genome sequence available for this subspecies.

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Complete Genome of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicusis Siphophage CN1A

Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicusis is a Gram-positive actinomycete that is the causative agent of the potato disease ring rot. Here, we announce the complete genome sequence of the Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicusis siphophage CN1A. CN1A is only the second fully sequenced Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicusis phage reported to date. Core and unique features of i...

متن کامل

بیماریزایی و تنوع ژنتیکی استرین‌های Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus عامل بیماری پژمردگی یونجه در استان همدان

یونجه (Medicago sativa) از گیاهان مهم علوفه‌ای و استان همدان منطقه‌ای مناسب برای رشد آن است. پژمردگی باکتریایی یونجه که توسط Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus ایجاد می‌شود، یکی از بیماریهایی است که سبب کاهش محصول در این استان می‌شود. این بیماری تاکنون به صورت جامع در استان همدان مورد بررسی قرار نگرفته است. در این بررسی از مناطق مختلف یونجه‌‌کاری استان همدان نمونه‌برداری و باکتری عامل ...

متن کامل

Draft Genome Sequence of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis Strain DOAB 397, Isolated from an Infected Field Corn Plant in Manitoba, Canada

In 2014, the pathogen Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis was isolated from symptomatic corn leaves in Manitoba, Canada. We report the draft genome sequence of C. michiganensis subsp. nebraskensis DOAB 397, consisting of 3.059 Mb with 73.0% G+C content, 2,922 predicted protein-coding sequences, 45 tRNAs, 3 rRNAs, and 37 pseudogenes.

متن کامل

Complete Genome Sequence of Salmonella enterica Serovar Typhimurium Strain SO2 (Sequence Type 302) Isolated from an Asymptomatic Child in Mexico.

The complete genome sequence ofSalmonella entericaserovar Typhimurium strain SO2, isolated from an asymptomatic child in Mexico, was determined using PacBio single-molecule real-time technology. Strain SO2 has six complete chromosomal prophages, namely, ST104, Gifsy-2, ST64B, Gifsy-1, ELPhiS, and FSL SP-004, and carries aSalmonellavirulence plasmid.

متن کامل

Comparative genomics of Clavibacter michiganensis subspecies, pathogens of important agricultural crops

Subspecies of Clavibacter michiganensis are important phytobacterial pathogens causing devastating diseases in several agricultural crops. The genome organizations of these pathogens are poorly understood. Here, the complete genomes of 5 subspecies (C. michiganensis subsp. michiganensis, Cmi; C. michiganensis subsp. sepedonicus, Cms; C. michiganensis subsp. nebraskensis, Cmn; C. michiganensis s...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

ثبت نام

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

عنوان ژورنال:

دوره 3  شماره 

صفحات  -

تاریخ انتشار 2015